Der Grundauftrag ist der Schutz der Bevölkerung und ihrer Lebensgrundlagen bei Katastrophen, Notlagen und schweren Mangellagen sowie im Fall eines bewaffneten Konflikts. Der Bevölkerungsschutz 
trägt dazu bei, Schäden zu begrenzen und Ereignisse zu bewältigen.

Der Bevölkerungsschutz baut auf den Mitteln des Alltags auf und stellt die Koordination und die Zusammenarbeit der fünf Partnerorganisationen sicher. Bei Bedarf können weitere Institutionen, private Organisationen und Unternehmen, Zivilschutzdienstleistende sowie die Armee zur Unterstützung beigezogen werden.

Stehen mehrere Partnerorganisationen während längerer Zeit im Einsatz, übernimmt ein gemeinsames Führungsorgan die Koordination und Führung.

Auf Stufe Kanton Aargau ist dieses Führungsorgan der Kantonale Führungsstab (KFS). Auf Stufe Gemeinden sind es die Regionalen Führungsorgane (RFO).